双软认定和高新技术企业认定的区别是什么呢？

1.国家政策依据不同

国家高新技术企业认定管理办法是为扶持和鼓励高新技术企业的发展，根据《中华人民共和国企业所得税法》、《中华人民共和国企业所得税法实施条例》，国家知识产权战略发展规划、中国加入国际组织（WTO）等一系列政策的指引与配套政策出台下诞生，主要是规划、引导企业的生产、科研、日常制度等规范化，符合国家相关战略思路。

软件企业认定管理办法是关于贯彻国务院鼓励软件产业和集成电路产业发展若干政策实施意见，进一步推动本市软件产业和集成电路产业的发展，结合本市实际情况，制定的相关政策。

软件产业是知识经济时代的主导产业，对推动经济发展具有极其重要的战略意义。运用市场机制，优化资源配置，鼓励自主创新，通过在政策、资金上予以特别支持，推动软件产业的跨越式发展，保持软件产业在全国的领先地位，并尽快达到或接近国际先进水平。

2.政府审批部门不同

高新技术企业认定由各省、自治区、直辖市、计划单列市科技行政管理部门同本级财政、税务部门联合评审。

软件企业由软件协会负责评审。

3.有效年限和年审规定不同

高新技术企业有限期为三年，三年复审，第六年重新认定。拟认定的高新技术企业每年按照相关规定申报统计和科委备案，同时在地方企业所得税减免所在地办理减免备案。

软件企业实行每年年检，根据软件企业管理办法规定的指标和资料，提供相关资料，每年的六月份之前办理软件企业年检。如果通过了，可以享受上一年度的企业所得税减免，如果没有通过，不能再享受企业所得税减免。

4.所享受的企业所得税优惠不同

高新技术企业认定后，在地方税务局备案后，企业所得税由原先的25%减少为15%。企业需要每年在税务局做高新技术企业备案，通过后，才能享受到优惠政策。

软件企业认定，在税务局备案后，自获利年度起，第一年和第二年免征企业所得税，第三年至第五年减半征收企业所得税。享受完五年优惠后，不再享受任何企业所得税优惠政策（包括高新企业优惠政策），企业所得税按照25%征收。

企业先申请哪一项认证呢？

建议企业先申请双软认定。以软件产品认定为例，软件产品经登记生效后，自2000年6月24日起至2010年底以前，对增值税一般纳税人销售其自行开发生产的软件产品，17%的法定税率征收增值税后，对其增值税实际税负超过3%的部分实行即征即退政策。所退税款由企业用于研究开发软件产品和扩大再生产，不作为企业所得税应税收入，不予征收企业所得税。软件产品登记的有效期为五年，五年的税收优惠期满后，再申请高新，这样成本比较低。如果是为了增加企业资质，用于招投标，则可以同时申请。

以上内容就是双软认定与高新技术企业认定之间的区别，以及申请哪项优先申请的内容，企业可以根据自身情况来选择申请双软认定或者是高新技术企业认定。